PL/PGSQLでダウンサンプリングしたい

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先日あるお客様との会話で、膨大なデータをグラフにするのに、pg_cronでaggregation(事前集計)をかけておけば、そのグラフをダッシュボードでインタラクティブにスケールを変更しつつ、少ないデータをfetchするだけで良いので、むっちゃ軽快な動作をするようにできまっせ、という話になった。

で、aggregationの内容はハンズオンラボ用に書いたPL/PGSQLを見てもらえば分かる通り、AVG / MIN / MAXを取るだけなので、折れ線グラフにした時に特徴を表すかというと非常に微妙、という説明をしたところ、そのお客様がLTTB(Largest Triangle Three Buckets)アルゴリズムというのがあって、という情報を提供してくれた。

不勉強なもので知らなかったため調べてみると、Qiitaに書いてくれてる人がいるので、まあそこからたどってGitHubのまとめページに行き着いた。特に難しいことをやってるわけではないのだけれど、残念ながらPL/PGSQLで書いてる人がおらん。PL/PGSQLで書かれてれば、CREATE FUNCTIONしてpg_cronで定期的に呼び出してやりゃイイ訳で、じゃ書くかと午前中から書いて今に至る、と。

元データから描いた折れ線グラフ
PL/PGSQLでダウンサンプリングして描いたグラフ

GitHubに放流しておいた。

CREATE OR REPLACE FUNCTION largest_triangle_three_buckets(data POINT[], threshold INT)
RETURNS POINT[] AS $$
DECLARE
    a INT := 1;
    next_a INT;
    max_area_point POINT;
    bucket_size DOUBLE PRECISION;
    tmp_p POINT;
    avg_x DOUBLE PRECISION;
    avg_y DOUBLE PRECISION;
    avg_range_start INT;
    avg_range_end INT;
    avg_range_length INT;
    range_offs INT;
    range_to INT;
    point_ax DOUBLE PRECISION;
    point_ay DOUBLE PRECISION;
    max_area DOUBLE PRECISION;
    area DOUBLE PRECISION;
    sampled point[] := '{}';
BEGIN
    -- Validate input data and threshold
    IF array_length(data, 1) IS NULL OR threshold <= 2 OR threshold >= array_length(data, 1) THEN
        RAISE EXCEPTION 'Invalid data or threshold';
    END IF;

    -- Initialize variables
    bucket_size := CAST(array_length(data, 1) - 2 AS DOUBLE PRECISION) / (threshold - 2);
    -- RAISE NOTICE 'bucket_size: %', bucket_size;

    -- Always include the first data point
    sampled := array_append(sampled, data[1]);

    -- Downsample the data
    FOR i IN 0..threshold - 3 LOOP
        -- Calculate the average x and y values for the next bucket
        avg_range_start := FLOOR((i + 1) * bucket_size) + 1;
        avg_range_end := LEAST(FLOOR((i + 2) * bucket_size) + 1, array_length(data, 1));
        avg_x := 0;
        avg_y := 0;
        avg_range_length := avg_range_end - avg_range_start;
        -- RAISE NOTICE 'avg_range_length: %', avg_range_length;

        FOR j IN avg_range_start..avg_range_end - 1 LOOP
            tmp_p := data[j];
            avg_x := avg_x + tmp_p[0];
            avg_y := avg_y + tmp_p[1];
        END LOOP;

        avg_x := avg_x / avg_range_length;
        avg_y := avg_y / avg_range_length;
        -- RAISE NOTICE 'avg_x: %', avg_x;
        -- RAISE NOTICE 'avg_y: %', avg_y;

        -- Determine the point that forms the largest triangle with point a and the average point
        max_area := -1;
        range_offs := FLOOR(i * bucket_size) + 1;
        range_to := FLOOR((i + 1) * bucket_size) + 1;
        tmp_p := data[a];
        point_ax := tmp_p[0];
        point_ay := tmp_p[1];

        FOR j IN range_offs..range_to - 1 LOOP
            tmp_p := data[j];
            area := ABS((point_ax - avg_x) * (tmp_p[1] - point_ay) - (point_ax - tmp_p[0]) * (avg_y - point_ay)) * 0.5;
            IF area > max_area THEN
                max_area := area;
                max_area_point := data[j];
                next_a := j;
            END IF;
        END LOOP;

        -- Add the point with the largest area to the downsampled data
        sampled := array_append(sampled, max_area_point);
        a := next_a;
    END LOOP;

    -- Always include the last data point
    sampled := array_append(sampled, data[array_length(data, 1)]);
    RETURN sampled;
END;
$$ LANGUAGE plpgsql;

pg_cronで使うなら、largest_triangle_three_buckets()にクエリ結果とthresholdを引数として渡すように変更すればよろし。

追記:sin波をダウンサンプリングするとどうなるのか。

-- 100件にダウンサンプリングするクエリ
WITH selected_data AS (
    SELECT array_agg(POINT(x, sin(radians(x)))) AS data_array
        FROM generate_series(-180, 180, 0.1) AS x
)

SELECT * FROM largest_triangle_three_buckets(
    (SELECT data_array FROM selected_data),
    100
);
3600レコード
100件にダウンサンプリング
50件
20件
10件

10件でも特徴は分かりそう。

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